TRIGUN STAMPEDE

灼熱的行星——荒漠之星。在這個星球上，有一位人稱「人形颱風」，價值600萬＄＄懸賞金的問題人物。 那個人名叫威席・史坦畢特。 記者羅伯特與梅麗魯在追查「PLANT連續搶劫案」的途中，遇見了某個男人...！？

威席僅以一發子彈，化解了城鎮的危機。然而，鎮上居民得知他價值600萬＄＄懸賞金，便轉而追捕他... 更麻煩的是，逃獄的凶惡罪犯「內布拉斯加父子」也加入追捕的行列，威席再度身陷危險！這個正如別名「人形颱風」的問題人物，究竟能不能獲得片刻的安寧呢…

PLANT搶劫事件告一段落，傑諾羅克鎮舉杯慶祝，沒想到只是片刻的和平，居民們突然遭到自驅式炸彈襲擊。 威席一行人得知這是出自「E．G．地雷」之手，想阻止引爆，卻在這時出現一名男子…

密利歐．奈布茲奪走PLANT，留下滿目瘡痍的城鎮。威席為了尋找他，來到第三都市儒來。 一行人在路上碰到自稱是「葬儀社」的神祕男子。他背著用布層層包覆的巨大十字架，身穿在沙摸中特別突兀的黑色西裝。那個男子自稱是「尼古拉・D・伍夫伍德」。

尼古拉加入威席一行人，旅程忽然變得更熱鬧。眾人繼續追尋奈布茲，半路上經過矗立在紅色沙漠的邊境村莊「風車之村」。 沒有起風，風車發揮不了功能。本來以為是毫無人煙的廢墟，殊不知有一股巨大殺氣向威席襲來……

威席與尼古拉搭乘橫渡砂之海的船艦──砂汽船，朝向第三都市儒來前進。兩人正以為平安出航，一位新的刺客──利維歐突然現身。雙方展開激烈槍戰．此時尼古拉回想起自己的過往。

為了阻止喪失自我的刺客——利維歐繼續失控，威席與尼古拉並肩作戰。船上展開槍戰，再加上敗德少年團在這時襲來，戰況越來越激烈。 在一連串混亂當中，不知是誰修改了砂汽船的航道，本來朝向第三都市儒來航行，卻突然失去控制，朝著尼古拉的故鄉「希望島」高速行進。

很久以前，四處尋找新行星的人類移民船碰上突發事故。少年威席與少年奈布茲在蕾萌的救助下，搭乘逃生艇，抵達荒漠之星。威席在無邊無際的沙漠迷失方向，逐漸失去意識……

威席跟著露伊塔與布萊德一起生活；另一方面，奈布茲跟著從移民船團集體墜落事件＜大墜落＞生還的研究組織領導人──康納德一同行動。 就在某一天，在急於復興的聚落設施，生物動力爐「PLANT」發生異常。在染上鮮紅色的PLANT的光芒之下，分道揚鑣的雙胞胎在此重逢。

梅麗魯與羅伯特被薩吉帶至第三都市儒來。兩人在此得知人類為何來到此地──荒漠之星。原為罪人的領導人，於「米迦勒之眼」反覆進行人體改造的研究員康納德也現身，一切即將水落石出。 與此同時，威席與尼古拉終於來到奈布茲所在的儒來鐵塔最上層。在沒有終點的旅途的盡頭，將迎來什麼樣的命運……

威席被奈布茲擺了一道，摔進了巨大水缸。水缸裡都是連接PLANT的溶液，奈布茲強制進入了威席的記憶世界。即使遭到人類厭惡，威席依舊深愛並保護人類。支撐著他的珍貴回憶是……。 另外，追在威席後面，沿路折返的梅麗魯將看到不可置信的景象。